Es el organismo responsable del seguimiento e implementación de las actividades del Consorcio.
Está compuesto por seis miembros, dos de cada miembro fundador del Consorcio: el Presidente y el Vicepresidente (uno del Ministerio de Economía y Empresa – MINECO) y el otro de la Comunidad Autónoma de Castilla y León -CCYL), y cuatro miembros de la Junta, uno del MINECO, uno del CCYL y dos de la Universidad de Salamanca.
Al menos, un representante de cada institución también debe ser miembro del Consejo de Rectores.
El secretario del Consejo Rector también trabaja como secretario en la Comisión Ejecutiva. Él y el Director de CLPU asisten a las reuniones como participantes sin derecho a voto.
El Presidente y el Vicepresidente de la Comisión siguen el mismo sistema de rotación que el Consejo de Rectores, teniendo en cuenta que ninguna institución puede ocupar la presidencia de ambos órganos al mismo tiempo.
COMISIÓN EJECUTIVA:
- PRESIDENTE
Dª. Blanca Ares González
Directora de Universidades e Investigación. Consejería de Educación. Gobierno de Castilla y León. - VICEPRESIDENTE
Dª Ángela Fernández Curto
Subdirectora General Adjunta de Grandes Instalaciones Científico Técnicas. Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades. - SECRETARIO
D. Gerardo Arévalo Vicente
Jefe del Servicio de Asuntos Económicos. Universidad de Salamanca. - MIEMBROS
D. Jesús M. Hurtado Olea
Secretario General de Educación Consejería de Educación. Gobierno de Castilla y León.Dª.Beatriz Albella Rodríguez
Jefa de Área de la Subdirección General de Grandes Instalaciones Científico-Técnicas. Ministerio de Ciencia e Innovación.D. José M. Mateos Roco
Vicerrector de Investigación y Transferencia. Universidad de SalamancaD. Javier González Benito
Vicerrector de Economía. Universidad de Salamanca.