Actualmente trabaja en el campo de la radioprotección en el CLPU de Salamanca. La aparición de pulsos láser de femtosegundo ultraintensos ha abierto la posibilidad de realizar una nueva clase de experimentos en los que se pueden generar y acelerar partículas y fuentes de radiación ionizante. En el CLPU, nos ocupamos de los aspectos relacionados con la radioprotección derivados del uso de fuentes láser, trabajando en diversas áreas vinculadas a la protección radiológica. Su principal interés se centra en la detección, que es uno de los aspectos más relevantes para fines de radioprotección.

En los últimos años, José Manuel Álvarez ha trabajado como investigador posgraduado en el Instituto de Ciencias del Espacio (ICE) en Barcelona, España. Ha participado en diversos proyectos de investigación relacionados con el desarrollo de tecnologías de detectores necesarias para futuras misiones espaciales de rayos gamma. Anteriormente, disfrutó de una beca de investigación en el GSI de Darmstadt, Alemania, orientada a la preparación de experimentos con el láser PHELIX.